MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV6

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015181	AAC	2	6	42	47	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168263
2	NC_015181	GCG	2	6	64	69	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168263
3	NC_015181	GTT	2	6	96	101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168263
4	NC_015181	AGG	2	6	152	157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168263
5	NC_015181	T	6	6	164	169	0 %	100 %	0 %	0 %	325168263
6	NC_015181	CGA	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168263
7	NC_015181	GCC	2	6	252	257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168263
8	NC_015181	ACG	2	6	332	337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168263
9	NC_015181	GCT	2	6	343	348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168263
10	NC_015181	GAG	2	6	349	354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168263
11	NC_015181	GAA	2	6	370	375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168263
12	NC_015181	AAAG	2	8	388	395	75 %	0 %	25 %	0 %	325168263
13	NC_015181	GTG	2	6	514	519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168263
14	NC_015181	GCTGA	2	10	604	613	20 %	20 %	40 %	20 %	325168263
15	NC_015181	GTGG	2	8	695	702	0 %	25 %	75 %	0 %	325168264
16	NC_015181	CGAT	2	8	745	752	25 %	25 %	25 %	25 %	325168264
17	NC_015181	GCTT	2	8	868	875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015181	CGC	2	6	888	893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015181	GTG	2	6	945	950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015181	ACCCC	2	10	970	979	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_015181	GCC	2	6	1030	1035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168265
22	NC_015181	ACCAA	2	10	1038	1047	60 %	0 %	0 %	40 %	325168265
23	NC_015181	AGA	2	6	1071	1076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168265
24	NC_015181	TCCCA	2	10	1153	1162	20 %	20 %	0 %	60 %	325168265
25	NC_015181	ACA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168265
26	NC_015181	TAAT	2	8	1227	1234	50 %	50 %	0 %	0 %	325168265
27	NC_015181	CCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168265
28	NC_015181	AAT	2	6	1598	1603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168266
29	NC_015181	GCG	2	6	1620	1625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168266
30	NC_015181	TGT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168266
31	NC_015181	GCGA	2	8	1686	1693	25 %	0 %	50 %	25 %	325168266
32	NC_015181	GAA	2	6	1764	1769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168266
33	NC_015181	CCG	2	6	1925	1930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168266
34	NC_015181	GGGC	2	8	1951	1958	0 %	0 %	75 %	25 %	325168266
35	NC_015181	GCG	2	6	2038	2043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168266
36	NC_015181	CGGT	2	8	2053	2060	0 %	25 %	50 %	25 %	325168266
37	NC_015181	C	6	6	2116	2121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_015181	ATCC	2	8	2154	2161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015181	CCA	2	6	2179	2184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015181	TCA	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015181	AAC	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168267
42	NC_015181	GTTT	2	8	2310	2317	0 %	75 %	25 %	0 %	325168267
43	NC_015181	TGC	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
44	NC_015181	GGTCAG	2	12	2383	2394	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325168267
45	NC_015181	GCAA	2	8	2402	2409	50 %	0 %	25 %	25 %	325168267
46	NC_015181	CGGCT	2	10	2411	2420	0 %	20 %	40 %	40 %	325168267
47	NC_015181	CCGGCG	2	12	2483	2494	0 %	0 %	50 %	50 %	325168267
48	NC_015181	TTG	2	6	2502	2507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168267
49	NC_015181	TGT	2	6	2532	2537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168267
50	NC_015181	CG	3	6	2548	2553	0 %	0 %	50 %	50 %	325168267
51	NC_015181	GC	3	6	2632	2637	0 %	0 %	50 %	50 %	325168267
52	NC_015181	CAT	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
53	NC_015181	GA	3	6	2716	2721	50 %	0 %	50 %	0 %	325168267
54	NC_015181	GCC	2	6	2771	2776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
55	NC_015181	GCT	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
56	NC_015181	ATT	2	6	2907	2912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168267
57	NC_015181	CTCC	2	8	2925	2932	0 %	25 %	0 %	75 %	325168267
58	NC_015181	TGC	2	6	3010	3015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
59	NC_015181	CGA	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168267
60	NC_015181	GCA	2	6	3058	3063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168267
61	NC_015181	CGGCG	2	10	3081	3090	0 %	0 %	60 %	40 %	325168267
62	NC_015181	GACG	2	8	3136	3143	25 %	0 %	50 %	25 %	325168267
63	NC_015181	GC	3	6	3191	3196	0 %	0 %	50 %	50 %	325168267
64	NC_015181	CTG	2	6	3251	3256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
65	NC_015181	CCG	2	6	3259	3264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
66	NC_015181	CGC	2	6	3271	3276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
67	NC_015181	AGG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168267
68	NC_015181	TGC	2	6	3357	3362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
69	NC_015181	ATC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
70	NC_015181	CGG	2	6	3411	3416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
71	NC_015181	CCG	2	6	3436	3441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
72	NC_015181	GCC	2	6	3461	3466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
73	NC_015181	GCC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
74	NC_015181	GCC	2	6	3583	3588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
75	NC_015181	CGG	2	6	3613	3618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
76	NC_015181	CGG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
77	NC_015181	TGC	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
78	NC_015181	CCGG	2	8	3740	3747	0 %	0 %	50 %	50 %	325168267
79	NC_015181	CCGATC	2	12	3780	3791	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325168267
80	NC_015181	TGC	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
81	NC_015181	GCC	2	6	3842	3847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
82	NC_015181	CGC	2	6	3912	3917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
83	NC_015181	TGC	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
84	NC_015181	CTG	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
85	NC_015181	CG	3	6	4140	4145	0 %	0 %	50 %	50 %	325168267
86	NC_015181	CAC	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168267
87	NC_015181	CGC	2	6	4207	4212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
88	NC_015181	CGC	2	6	4216	4221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
89	NC_015181	CAT	2	6	4222	4227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
90	NC_015181	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
91	NC_015181	GAT	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168267
92	NC_015181	CGG	2	6	4327	4332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168267
93	NC_015181	CG	3	6	4413	4418	0 %	0 %	50 %	50 %	325168267
94	NC_015181	CGA	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168267
95	NC_015181	GCT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
96	NC_015181	CAT	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
97	NC_015181	CCA	2	6	4477	4482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168267
98	NC_015181	CCG	2	6	4518	4523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
99	NC_015181	CTG	2	6	4556	4561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
100	NC_015181	GCT	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168267
101	NC_015181	ACC	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168267
102	NC_015181	CATC	2	8	4719	4726	25 %	25 %	0 %	50 %	325168267
103	NC_015181	GCC	3	9	4769	4777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
104	NC_015181	GGA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168267
105	NC_015181	GCGCC	2	10	4921	4930	0 %	0 %	40 %	60 %	325168267
106	NC_015181	TTC	2	6	4934	4939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168267
107	NC_015181	TCA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168267
108	NC_015181	CCG	2	6	5013	5018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
109	NC_015181	ATCT	2	8	5039	5046	25 %	50 %	0 %	25 %	325168267
110	NC_015181	GAT	2	6	5093	5098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168267
111	NC_015181	CGC	2	6	5115	5120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
112	NC_015181	CGC	2	6	5227	5232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168267
113	NC_015181	GTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168268
114	NC_015181	ACCCAC	2	12	5313	5324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168268
115	NC_015181	GT	3	6	5335	5340	0 %	50 %	50 %	0 %	325168268
116	NC_015181	AGC	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168268
117	NC_015181	GATG	2	8	5496	5503	25 %	25 %	50 %	0 %	325168268
118	NC_015181	TTC	2	6	5557	5562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168268
119	NC_015181	CGC	2	6	5577	5582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168268
120	NC_015181	TGG	2	6	5597	5602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168268
121	NC_015181	GTC	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168268
122	NC_015181	CGA	2	6	5682	5687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168268
123	NC_015181	ACA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168268
124	NC_015181	CGA	2	6	5814	5819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168268
125	NC_015181	TCC	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168268
126	NC_015181	GCG	2	6	5898	5903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168268
127	NC_015181	GC	3	6	5942	5947	0 %	0 %	50 %	50 %	325168268
128	NC_015181	CTGG	2	8	6031	6038	0 %	25 %	50 %	25 %	325168268
129	NC_015181	GCC	2	6	6050	6055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168268
130	NC_015181	GCG	2	6	6072	6077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168268
131	NC_015181	GC	3	6	6154	6159	0 %	0 %	50 %	50 %	325168268
132	NC_015181	AACGG	2	10	6165	6174	40 %	0 %	40 %	20 %	325168268
133	NC_015181	ACG	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168268
134	NC_015181	GGC	2	6	6238	6243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168268
135	NC_015181	CGT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168268
136	NC_015181	TAG	2	6	6343	6348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_015181	ATC	2	6	12109	12114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.